Arbetet i NPO speglar hela vårdkedjan - från prevention, symtom och kontakt till att utreda, ställa diagnos, behandla, rehabilitera, ge palliativ vård och följa upp. NPO ska bidra i utvecklingen och användningen av kvalitetsregistren. Syftet är att registren ska fortsätta att bidra till att skapa en god, jämlik och kunskapsbaserad vård.
I samtliga programområdens uppdrag med Nationella Kvalitetsregister ingår att: